Forschungs- \n infrastruktur

Forschungs-
infrastruktur

AGs Bioorganische Chemie und
Organische Chemie

Forschungsinfrastruktur

(Bio-)organische Synthese
Probenaufbereitung
Chemische und Bioanalytik
Bioaktivitätsstudien
Computer-gestützte Studien
Inhaltsverzeichnis
(Bio-)organische Synthese
Probenaufbereitung
Chemische und Bioanalytik
Bioaktivitätsstudien
Computer-gestützte Studien

(Bio-)organische Synthese


Synthese modizifierter Fettsäuren

  • manuelle Synthese, Modifikation und Markierung

Ansprechpartner: Prof. Dr. Wolfgang Imhof (AG Organische Chemie)


Festphasen-Peptidsynthese

  • manuelle Synthese
  • Mikrowellen-assistierte manuelle Synthese
  • automatisierte Synthese

Ansprechpartnerin: Jun.-Prof. Dr. Marie-T. Hopp (AG Bioorganische Chemie)

© M. Hopp

MultiPep 1 (Parallel-Peptidsynthesizer, CEM): Automatisierte Festphasenpeptidsynthese, automatisierte Synthese von Peptid-Arrays am Harz in 96-Well-Filterplatten und von membrangebundenen Peptidarrays (SPOT-Synthese).

© M. Hopp

ETHOS lab (leistungsfähiges Mikrowellen-Aufschlusssystem, MLS-MWS): Dual-Magnetron-Anordnung, MW-Eintrag kontinuierlich oder gepulst von 0 bis 1600 Watt, Probenraumvolumen von 70 Liter (aktuelle genutzt für die Synthese komplexer Peptide).

Probenaufbereitung


Aufschluss/extraktion, AUfkonzentration und Trocknung von Analyten

  • Extraktion von Mikroplastik
  • Extraktion von Naturstoffen
  • Rotationsverdampfung
  • Gefriertrocknung
  • Trocknung in Trocken- und Vakuumstrockenschränken
  • Inkubator
  • Thermoschüttler
  • versch. Zentrifugen

Ansprechpartner: Prof. Dr. Wolfgang Imhof (AG Organische Chemie) und Jun.-Prof. Dr. Marie-T. Hopp (AG Bioorganische Chemie)

© M. Hopp

EDGE (Lösungsmittelextraktionssystem, CEM): Automatisierte Lösemittel-Extraktion.

Alpha 2-4 LSCplus (Gefriertrocknungsanlage, Christ): 4 kg Kondensatorkapazität, -85°C Kondensatortemperatur, chemikalienresistente Vakuumpumpe.

RVC 2-18 Cdplus (Rotations-Vakuumkonzentrator, Christ): HCl-beständige Ausführung mit Kühlfalle, Nutzung mit 1,5/2 ml oder 10 ml Tubes möglich.

© M. Hopp

Incucell (Inkubator, MMM Medcenter): akkurate Temperaturregelung (30-100°C), natürliche Luftzirkulation, 55 l Kammervolumen.

VD56 (Vakuumstrockenschrank, Bender): Temperaturbereich: 9-220°C, Druckbereich: bis <10 mbar, 55 l Kammervolumen.

versch. Trockenschränke

Reinigung von PRoteinen und Peptiden

  • FPLC (SEC)

Ansprechpartnerin: Jun.-Prof. Dr. Marie-T. Hopp (AG Bioorganische Chemie)

© M. Hopp

ÄKTA purifier (FPLC, SEC, Amersham/Cytiva): Proteinaufreinigungssystem mit UV-Detektor. Verschiedene SEC-Säulen vorhanden.

Chemische und Bioanalytik


Analytik niedermolekularer Verbindungen

  • Gaschromatographie mit Massenspektrometrie-Kopplung (GC-MS)
  • Kernspinresonanzspektroskopie (NMR)

Ansprechpartner: Prof. Dr. Wolfgang Imhof (AG Organische Chemie)

© M. Hopp

ChromTech Evolution Massenspektrometer gekoppelt an Agilent Technologies 6890N Network GC-System mit Autosampler.

Spinsolve 80 Ultra (Benchtop-NMR, Magritek): 1H-Frequenz: 80 MHz, Kerne: 1H, 13C, 19F, PFG-Einheit (DOSY), keine deuterierten Lösungsmittel notwendig (Signalunterdrückung), Sequenzen (Auswahl): 1D (decoupling), JRES, TOCSY, ROESY, WET, PRESAT, T1, T2, T2 filter, HSQC, HMQC, HMBC, DEPT, APT, Reaction monitoring

analytik insb. von Peptiden und Proteinen

  • Umkehrphasen-Hochleistungsflüssigkeitschromatographie (RP-HPLC)
  • Natriumdodecylsulfat-Polyacrylamidgelelektrophorese (SDS-PAGE)
  • UV/Vis-Spektroskopie
  • Fluoreszenzspektroskopie

Ansprechpartnerin: Jun.-Prof. Dr. Marie-T. Hopp (AG Bioorganische Chemie)

RP-HPLC (folgt...)

© M. Hopp

Specord 200 (UV/Vis-Spektralphotometer, Analytik Jena): Zwei-Strahl-Spektrophotometer, Monochromator, Wellenlängenbereich: 190-1100 nm, variable spektrale Bandbreite, Wellenlängengenauigkeit: 0,5 nm, Scangeschwindigkeit: bis zu 6000 nm/min.

POLARstar Galaxy (Fluoreszenz-Plate Reader, BMG Labtech): Absorption, Fluoeszenz-Intensität inkl. FRET, zeitaufgelöste Fluoreszenz (TRF), Lumineszenz, Fluoreszenz-Polarisation.

Bioaktivitätsstudien


Chromogene, fluorogene und Diagnostische Assaysysteme

  • UV/Vis-Spektroskopie
  • Fluoreszenzspektroskopie
  • Kugel-Koagulometrie

Ansprechpartnerin: Jun.-Prof. Dr. Marie-T. Hopp (AG Bioorganische Chemie)

Infinite 200 Pro (UV/Vis-Plate Reader, Tecan): Spektrophotometer für Mikrotiterplatten oder Küvetten, Monochromator, Wellenlängenbereich: 230-1000 nm.

Specord 200 (UV/Vis-Spektralphotometer, Analytik Jena): Zwei-Strahl-Spektrophotometer, Monochromator, Wellenlängenbereich: 190-1100 nm, variable spektrale Bandbreite, Wellenlängengenauigkeit: 0,5 nm, Scangeschwindigkeit: bis zu 6000 nm/min.

POLARstar Galaxy (Fluoreszenz-Plate Reader, BMG Labtech): Absorption, Fluoeszenz-Intensität inkl. FRET, zeitaufgelöste Fluoreszenz (TRF), Lumineszenz, Fluoreszenz-Polarisation.

KC4A (4-Kanal-Koagulometer, Amelung): Blutgerinnungs-Messgerät (Kugel-Methode), gleichzeitige Messung von 4 Proben möglich.

Computer-gestützte Studien


Leistungscomputer für Rechnungen und Simulationen

  • Server für DFT-Rechnungen
  • Leistungs-PCs für molekulares Docking und Molekulardynamik-Simulationen

AMD Dual operton Hochleistungs-Server von DELTA, 4 Servereinschübe (jeweils ausgestattet mit 2x 6212 AMD (Interlagos) 8-Core CPU, 32 GB RAM), Gaussian Programm für DFT-Rechnungen

Hyundai-ITMC Pentino, Intel Core i5-12400 Prozessor, 64 GB RAM DDR4 3200 MHz, 1 TB NVMe SSD, RTX A2000 6 GB Grafikkarte, Programm YASARA, In silico Simulations- (Peptide/Proteine) und Interaktionsstudien